单细胞抗体测序剖析服务

单细胞抗体手艺(single B cell antibody technology)是抗体发明的全新手艺手腕,通量下、漏筛率低,且没有体外挑选抗体不是自然配对的毛病,有着辽阔的远景。泓迅科技的单细胞抗体服务,包孕B细胞抗体的研发取制备,及B细胞抗体测序和深度剖析等。

B细胞,即B淋巴细胞,重要实行机体的体液免疫,正在抗原刺激下排泄发生抗体并发挥作用。正在适应性免疫应对时期,活化的B细胞扩增并阅历其B细胞受体(BCR)的体细胞超突变,构成多样化的细胞克隆。另外,抗体作为复合物份子,其每一个重链(VH)和沉链(VL)中存在三个互补决意区(CDR),而且重链的CDR3转变最为雄厚,可正在V,D和J基因区段之间的衔接处构成而且倾向于高水平的超突变。因而,B细胞发生的自然VH / VL抗体对明白抗体生物学和设想至关重要。

泓迅科技基于先辈的GenoTM Ab平台,供应专业的单细胞抗体测序剖析服务,可资助研究人员周全评价免疫系统的多样性,深切发掘免疫组库取疾病的干系。

服务上风

  • 专有的抗体大数据平台,可对抗体的重链和沉链配对停止打分,挑选最能够的完好抗体序列
  • 奇特的内部数据发掘东西,对抗体测序效果停止预处理,最大水平制止假阳性等测序偏差
  • 完备的生物信息学剖析,经验丰富的抗体研讨团队,深度发掘下代价信息
  • 服务流程

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    泓迅典范案例

    泓迅科技凭据客户所供应的抗体测序原始数据,经由过程生物信息学剖析,对细胞VDJ重构、V/J基因频次、V-J成对运用频次、CDR3长度剖析、B细胞克隆计数、受体多样性剖析、组间多样性差别剖析、组间V、J基因差别剖析、组间克隆表达CDR3长度散布差别等具体剖析,并提供了专业的研讨讲演。

    效果展现:
    1) VDJ 基因运用频次剖析

    Table BCR样本中 V 基因运用频次统计

    Gene_name Reads Frequency
    4-39*01 27980 4.97
    4-34*01 12488 2.22
    1-2*02 5007 0.889
    3-74*01 4798 0.852
    1-18*01 3011 0.535
    3-7*01 2862 0.508
    2-70*13 2313 0.411
    3-74*03 2240 0.398
    1-69*01 1943 0.345
    4-31*03 1583 0.281

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    2) CDR3 地区长度剖析

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    3) CDR3品种剖析

    BCR测序统计CDR3氨基酸序列长度

    CDR3 Reads Frequency len
    DNNNDMR 3560 0.004869 7
    VISRTL 1688 0.002308 6
    AVDSNYQLI 899 0.001229 9
    AVNRDDKII 718 0.000982 9
    AATDSWGKLQ 696 0.000952 10
    AVTDSWGKLQ 627 0.000857 10
    AVNTGNQFY 595 0.000814 9
    AVTGGGNKLT 573 0.000784 10
    AVPTGTASKLT 562 0.000769 11
    LVGDTGRRALT 540 0.000738 11
    AEITLT 517 0.000707 6

    4) 序列总长排序

    BCR氨基酸序列总长reads数

    氨基酸基因序列长度 氨基酸数量 品貌
    1491 147 0.096324
    20 139 0.044324
    540 143 0.040395
    529 145 0.041238
    516 147 0.041955
    504 143 0.042773
    496 141 0.043976
    441 145 0.040898
    433 145 0.041868
    387 148 0.039055

    5) 差别样本之间的VH基因的频次差别剖析

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    6) 样本测序饱和度剖析

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    7) 克隆多样性剖析

    克隆多样性剖析

    上机范例 Shannon Entropy Inverse Simpson
    BCR 19.7458 340.758

    服务详情

    服务称号 主要内容 剖析软件 托付周期 托付项目
    单细胞抗体测序剖析服务 测序数据发掘;
    抗体信息剖析等
    R, Python
    Software等
    7~10天 剖析讲演

    * 如需订购抗体测序服务,请相识相干服务:杂交瘤细胞抗体基因测序抗体组库/免疫组库测序,或详询support@synbio-tech.com

    抗体测序生信剖析服务订购

    1. Email:请将您的具体需求发送到support@synbio-tech.com
    2. 电话订购:您能够间接拨打免费热线4000-973-630转803123444.com经验丰富的工程师
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