SNP检测及剖析

SNP(单核苷酸多态性),是指正在基因组上因为单个核苷酸的变异构成的遗传符号。人类基因组中SNP位点总数凌驾300万个,且每个位点的多态性雄厚。正在人类可遗传的变异中,SNP占比凌驾90%。因为SNP正在人类基因组中数目较多,发作频次较下,因而被以为是继微卫星以后的新一代遗传学符号,正在医学遗传学、药物遗传学、疾病遗传学、疾病诊断学、和人类退化等研讨范畴皆有着很下的研讨代价和运用远景。

SNP研讨是人类基因组企图走向运用的主要步调。大量存在的SNP位点,使人们有机会发明取各种疾病,包孕肿瘤相干的基因组突变。研讨发明,人体很多表型差别、对药物或疾病的易感性等等皆取SNP有关。

泓迅科技正在SNP位点剖析和研讨方面积聚了雄厚的履历。泓迅的专业部队,借助先辈的仪器设备和独到的研讨战略和要领,不只能够供应基于Sanger法测序的“金尺度”SNP分型技术服务,也能够停止相对通量更大、本钱更低的Taqman探针法停止SNP分型服务。另外,泓迅周全的GPS(Genotype, Phenotype and Synotype)平台,有助于减速根蒂根基研讨的快速转化和运用,更好天资助客户展开SNP方面的研究工作,包孕SNP的功用学、下流运用的家当开辟。

服务内容

  1. 间接测序:SNP的检测要领有间接测序法、Taqman探针法、HRM法、焦磷酸测序法、SNaPShot和Sequenom法等。正在所有SNP的检测要领中,看待检测样本PCR扩增后间接停止测序是最为正确的要领,也是SNP剖析的“金尺度”。
  2. Taqman探针:该要领的道理基于及时荧光定量PCR的特异性。针对染色体上的差别的SNP位点离别设想一对PCR引物和一组Taqman探针,停止及时荧光PCR扩增。探针的5’端和3’端离别符号一个讲演荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中有PCR产品时,该探针取模板退火,即发生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’端衔接的荧光份子从探针上切割下来,损坏两荧光份子间的PRET,收回荧光。一般用于少许的已知SNP位点停止大量样本的剖析。

样品要求

样品品种 要求 生存和运输
血液 露抗凝剂,总大于1ml -20℃/-80℃,干冰运输
构造样品 新颖构造、白腊包埋或95%乙醇流动,大于50mg -20℃/-80℃,干冰运输
细胞或菌液 样品新颖、密封,计数大于106 4℃运输
血斑 枯燥,血斑大于0.5cm2 密闭,常温运输

 

实行讲演

  1. 间接测序法:实行讲演露原始测序峰图、比对文件和剖析讲演。
  2. Taqman探针法:实行讲演含分型散点图和剖析讲演。

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